栽培草莓基因组注释新版本发布

来源：BioArt植物

草莓是多年生草本植物，蔷薇科草莓属。草莓因芳香多汁、营养丰富受到人们的喜爱，在全国各地均可种植。栽培草莓为异源多倍体(Fragaria×ananassa，8n=56)，基因组复杂，杂合度高。2019年，Nature Genetics杂志发表了利用三代测序数据组装的高质量栽培草莓v1.0版本基因组(Edger et al., 2019)，极大地促进了草莓和其它蔷薇科植物的基因组学、分子生物学以及遗传学研究。然而，由于基因组注释时使用的转录组数据较少，仍存在基因组的注释准确度、完整度低等问题。

近日，Horticulture Research在线发表了湖北省农科院题为Reannotation of the cultivated strawberry genome and establishment of a strawberry genome database的研究论文，发表了高质量栽培草莓基因组注释。

新的基因组注释(v1.0.a2)总共包含108,447个蛋白编码基因，BUSCOs评估基因组完整度达到97.85%。与(v1.0.a1)注释相比较，v1.0.a2注释新增了360个新基因，提升了19,174个基因的结构，还为11,044个基因添加了转录本信息，并且搭建了草莓基因组数据库。同时，该研究还重新分析了草莓果实发育不同时期的转录组数据(Sánchez-Sevilla et al., 2017)，为草莓果实发育提供了有力的支撑。