华北理工大学王希胤课题组对现代榴莲基因组的研究取得新突破。研究论文近日在线发表于《植物生理学》。
课题组重新分析了榴莲基因组，并与棉花、可可、葡萄基因组进行比较，发现榴莲基因组的构成源于一次独有的六倍化事件，以及一次与其他双子叶植物共有的更古老的六倍化事件。
完整的榴莲基因组测序曾于2017年发表，提出榴莲和棉花共享基因组加倍事件，但并未明确多倍化事件的性质和规模。榴莲基因组公布后，王希胤课题组以葡萄、可可树为外类群，重新分析了榴莲和与其进化上相近的棉花基因组。课题组利用提出的植物复杂基因组软件流程，进行了基因组间同源基因点阵图分析、共线性基因与相关进化事件的联合分析、共线性基因构树分析和榴莲—棉花共线性基因的共有分析等。
研究发现，除双子叶植物共有的近1.3亿年前的六倍化事件之外，榴莲和棉花又各自经历了一次独立的多倍化事件。榴莲基因组经历了一次古六倍化事件，大约发生在2100万年前~1900万年前。而棉花基因组经历的是一次古十倍化事件，约发生在1400万年前~1300万年前。
研究指出，棉花基因组经历古十倍化事件后进化速率加快，使棉花基因的进化速率相对榴莲提高了约64%。而榴莲的古六倍体事件并未显著提高榴莲基因组的进化率，这可能与榴莲生命周期较长有关。
相关论文信息：DOI:10.1104/pp.18.00921
内容来源：中国科学报来源：中国科学报
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