饶子和/娄智勇/邓菲首次解析了分段负义RNA病毒聚合酶结构

iNature  |   2020-04-28 09:16

来源:iNature


分段的负义RNA病毒(sNSRVs)编码单多肽聚合酶(L蛋白)或异三聚体聚合酶复合物,以吞噬用作转录引物的宿主信使RNA帽结构,并催化RNA合成。

2020年4月27日,清华大学饶子和,娄智勇及武汉病毒所邓菲共同通讯在Nature Microbiology 在线发表题为“Structure of severe fever with thrombocytopenia syndrome virus L protein elucidates the mechanisms of viral transcription initiation”的研究论文,该研究报告了血小板减少症伴随着重度发烧的综合征病毒(SFTSV)L蛋白的全长冷冻电镜结构,分辨率为3.4Å:L蛋白包含三个功能部分的原子模型(核酸内切酶,RNA依赖性RNA聚合酶和帽结合结构域)和两个结构域(具有阻断剂基序的臂结构域和羧基末端套索结构域)。

SFTSV L蛋白具有紧凑的结构,其帽结合口袋令人惊讶地被阻断剂基序的Arg占据,并且核酸内切酶活性中心面向帽结合口袋,这表明结构域重排对于获得SFTSV L蛋白具有重要意义。该研究结果提供了对sNSRV编码的L蛋白完整结构的深入了解,并进一步了解了sNSRV转录起始。


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负义RNA病毒(NSRVs)编码具有多种酶功能的RNA依赖性RNA聚合酶(RdRp),以促进病毒转录和复制。非分段NSRV(nsNSRV)(丝状病毒,弹状病毒,副粘病毒和博纳病毒)和分段NSRV(sNSRV)(鼻病毒,布尼亚病毒和正粘病毒)RdRp的体系结构和功能-特别是生成信使RNA(mRNA)帽以启动的机制转录-完全不同。 


nsNSRVs通过在其大型聚合酶(L蛋白)中使用多核糖核苷酸转移酶(PRNTase)将新生的RNA转移至GDP受体上形成GpppN结构,从而在其后通过甲基转移酶对其进行修饰,合成mRNA帽结构。L蛋白添加2'-O和鸟嘌呤-N7修饰,形成7mGpppNpmNp帽结构。相比之下,sNSRVs具有形成帽结构的帽捕捉机制,从而通过L蛋白中的核酸内切酶(endoN)从宿主细胞mRNA切割短的5'帽RNA片段,从而引发病毒mRNA序列的合成。因此,sNSRV编码的L蛋白具有三个功能域:endoN域,RdRp域和帽结合域(CBD)。在Bunyavirales顺序中,L蛋白是单体单个多肽,而在正粘病毒中,异源三聚体复合物起聚合酶的作用。


水泡性口炎病毒L蛋白的结构以及人呼吸道合胞病毒(RSV)和人间质肺病毒PRNTase–RdRp的结构揭示了nsNSRV聚合酶的结构及其与辅因子的相互作用。流感病毒的PA,PB1和PB2结构剖析了三个亚基形成聚合酶复合物,合成RNA并将带帽引物引导至聚合酶活性腔的机制。此外,拉克罗斯病毒(LACV)的结构(覆盖残基1-1750)提供了sNSRV编码的RdRp如何结合模板病毒RNA(vRNA)的细节。但是,全长sNSRV编码的L蛋白的完整结构仍不清楚,这阻碍了我们对与RNA合成和转录起始相关的帽捕捉机制的理解。


重度发烧伴随着血小板减少症候群病毒(SFTSV)是正在出现的血小板减少症候群伴随着重症发烧的病原体,属于Bunyavirales中的Phenuiviridae家族,与裂谷热病毒(RVFV)和Uukuniemi病毒一起。世界卫生组织已将SFTSV列入需要紧急关注的优先目标病原体清单。此处报道的全长SFTSV L蛋白(SFTSV-L)的原子结构提供了对sNSRV编码L蛋白完整结构的结构洞察力,并为了解帽捕捉机制提供了信息。


具体来说,该研究报告了SFTSV L蛋白的全长冷冻电镜结构,分辨率为3.4Å:L蛋白包含三个功能部分的原子模型(核酸内切酶,RNA依赖性RNA聚合酶和帽结合结构域)和两个结构域(具有阻断剂基序的臂结构域和羧基末端套索结构域)。SFTSV L蛋白具有紧凑的结构,其帽结合口袋令人惊讶地被阻断剂基序的Arg占据,并且核酸内切酶活性中心面向帽结合口袋,这表明结构域重排对于获得SFTSV L蛋白具有重要意义。该研究结果提供了对sNSRV编码的L蛋白完整结构的深入了解,并进一步了解了sNSRV转录起始。

来源:Plant_ihuman iNature

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