来源:中外学术情报
冠状病毒与许多人类传染病爆发相关,例如2002年3月爆发的SARS以及2012年爆发的MARS。
虽然SARS样冠状病毒的来源在包括蝙蝠在内的一些哺乳动物身上都有检测到,但是此次新型冠状病毒的起源仍然不清楚。
复旦大学张永振教授研究团队于2020年2月3日在《Nature》上发表文章《A new coronavirus associated with human respiratory disease in China》,通过对比2019-nCoV病毒与多株SARS病毒的基因序列,推断了这种新病毒的可能来源。
张永振教授的研究主要针对一名在武汉海鲜市场工作并确诊为感染2019-nCoV病毒的患者的情况和样本进行观察、检测和分析。
患者为41岁的男性,在患病期间出现发烧、胸闷、咳嗽等症状,C反应蛋白明显增高(41.4 mg/L,参考区间0-6 mg/L),肺部CT异常,表现为毛玻璃样混浊等症状。
研究人员收集了该患者的支气管肺泡灌洗液(BALF),进一步分析了病毒的RNA序列。
图片转自Pixabay
通过对病毒全基因组的系统发育分析(29,903个核苷酸),发现该病毒与一组来自蝙蝠的SARS样冠状病毒(Betacoronavirus属,Sarbecovirus亚属)相似度达89.1%。
为确定武汉冠状病毒与以前已知的冠状病毒之间的进化关系,研究人员进行了不同类型的系统发育树分析。
其中,在S基因树分析中显示,2019-nCoVs与蝙蝠来源的冠状病毒bat-SL-CoVZC45最为相似,其氨基酸同源性为82.3%(与SARS CoV氨基酸同源性为77.2%)。
这次研究结果显示,通过对比多种冠状病毒,2019-nCovs与蝙蝠身上的冠状病毒最为相似,甚至与Bat-SL-CoVZC45这一株病毒的nsp7和E蛋白的相似度达100%。这表明蝙蝠很有可能是2019-nCoV的宿主。
然而要注意的是,首次出现患者的海鲜市场在当时出售的动物种类繁多,因此还需更进一步的工作来确认2019-nCoV的自然宿主和其他的中间宿主。
参考资料:
https://www.nature.com/articles/s41586-020-2008-3
来源:Academic_Information 中外学术情报
原文链接:https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzIyMjYzMzAxNw==&mid=2247499133&idx=6&sn=9ba71f238edda132aa15cb1d071115b8&chksm=e828302bdf5fb93dc01437ece7002f4f9c88486608cb1aadd5013d44ec129d1726018e3e3e94#rd
版权声明:除非特别注明,本站所载内容来源于互联网、微信公众号等公开渠道,不代表本站观点,仅供参考、交流、公益传播之目的。转载的稿件版权归原作者或机构所有,如有侵权,请联系删除。
电话:(010)86409582
邮箱:kejie@scimall.org.cn