来源:机器人大讲堂
2月1日,浙江省疾控中心上线自动化的全基因组检测分析平台。利用阿里达摩院研发的AI算法,可将原来数小时的疑似病例基因分析缩短至半小时。
疫情发生后,达摩院算法专家顾斐博士立即奔赴浙江省疾控中心,第一时间针对新型冠状病毒基因进行特征分析,并推出多个算法模型。在序列比对过程中,达摩院对算法增加了分布式设计,有效提升比对。
阿里巴巴相关负责人2月1日表示,“可以这么理解,全基因序列的分析比对会产生大量数据,并需要大量计算,缩短时间的本质就是优化算法提高计算效率和分析能力。”这种分布式的设计和区块链技术并不相同,而是类似于云计算。
当前,全国新型冠状病毒肺炎疫情依然严峻,快速、精确诊断对于疫情控制尤其重要。公开信息显示,该病毒是基因组序列最长的病毒之一,全基因组序列全长29847bp,临床诊断需要将患者样本与该病毒基因序列进行比对才能确定诊断结果。
目前医院普遍采用核酸检测方法,其只能检测到病毒基因的局部。由于病毒存在变异的可能性,对于整个基因序列来说这种检测方法犹如盲人摸象,一旦病毒发生变异,就可能出现漏检。
浙江的全基因组检测分析平台由浙江省疾病预防控制中心、阿里达摩院医疗AI团队和杰毅生物技术公司共同研发。该平台采用不同于核酸检测方法的全基因组检测技术,对疑似病例的病毒样本进行全基因组序列分析比对,能够有效防止病毒变异产生的漏检,并将原需数小时的全基因分析流程减少到半小时,大幅提高疑似病例的确诊速度和准确率。
浙江省疾控中心基因测序负责人孙逸博士表示:“该平台基于阿里云的强大算力与达摩院新算法可以为病毒的解析提供支撑,基于该平台,未来还可以在短时间内将检测范围覆盖整个确诊病例,也为后续疫苗与药物研发打下了坚实基础。”
阿里巴巴相关人士对记者透露,后续达摩院还将参与疫苗技术的研发,同样也是医疗ai的算法分析和算力支持。
我们成功从死神手里抢回了宝贵的时间!要知道,新型冠状病毒是有史以来基因组序列最长的病毒之一,全长29847bp,更可怕的是它随时可能发生变异!传统局部检测早已不大适用,此次浙江采用的全基因组检测技术,能有效防止病毒变异产生的漏检。达摩院科学家更针对性研发多个AI算法比对模型,大大提升了检测效率,为后续疫苗与药物研发打下坚实基础!
来源:RoboSpeak 机器人大讲堂
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