新型冠状病毒“通缉照”,你看懂了吗?

科技工作者之家  |   2020-01-26 12:08

1月24日,国家病原微生物资源库发布了由中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所成功分离的我国第一株病毒(新型冠状病毒武汉株01)毒种信息和电镜照片。

传播疫情的罪魁祸首,人们终于能通过照片“通缉”它了。在高倍放大的电镜照片中,新型冠状病毒圆圆、团团的。但它的照片能告诉人们什么信息?相信很多人一头雾水。

在发布照片的同时,国家病原微生物资源库还发布了新型冠状病毒核酸检测引物和探针序列等重要权威信息。

1月26日,科技日报记者独家采访病毒学专家、美国加州大学圣迭戈分校医学院教授Robert Naviaux,为公众解疑释惑。

1.发布的新型冠状病毒电镜照片中传递出了哪些信息?

Robert Naviaux:首先,我们看到病毒的尺寸,照片上标明了它的直径大概是100纳米。这意味着,当病毒颗粒与感染者体液结合后,其尺寸可以达到5微米以上。那么,由于N95口罩能够过滤掉的最小的颗粒直径是0.3微米,所以N95口罩基本上能够阻止99%以上的病毒。

其次,通过照片可以看出病毒的形状:新型冠状病毒是圆形的,周围环绕着一圈突刺蛋白 (Spike protein),像一个皇冠,或者太阳的稀疏日冕(注:冠状病毒在很久之前的论文中也叫“日冕病毒”)。

2.怎样才能拍出病毒电镜照片?

Robert Naviaux:这是一个病毒的透射电镜(Transmission electron micrograph)的照片。拍摄透射电镜照片一般的步骤是:(1)从感染新型冠状病毒的病人的人气道上皮细胞培养液中离心,取上清液得到含有病毒的液体;(2)用2%多聚甲醛灭活;(3)用2.5%戊二醛固定在支持膜上(类似于载玻片),用一系列乙醇脱水处理;(3)包埋在超薄树脂中,制作成切片;(4)透射电镜扫描。

3.病毒引物探针序列公布之后,都能做哪些研究?

Robert Naviaux:这种病毒,与其他的常见的冠状病毒相比,具有比较大的差异,目前的临床手段,很难检测到。急需新的、更加准确的检测手段。

探针的公布,能够帮助开发快速分子检测方法。如PCR (polymerase chain reaction) 法,可以根据探针序列,设计特异性引物,来特异性的检测该种病毒。也能为设计分子靶向药物,以及疫苗的设计提供指导信息。

此外,通过其公布的探针序列,利用基因组学、蛋白质组学和新一代的代谢组学等手段能够预测该病毒入侵机体的特异性的分子识别特征 (Damage-associated molecular patterns),比如说,全身炎症反应等,对病人进行个性化治疗。

4.关于电镜照片的获得和引物、探针序列的公布和共享,您如何评价这一进展

Robert Naviaux:中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所近期公布的新型冠状病毒的电镜照片和探针,具有很重大的意义。主要是2个方面:

(1)这一研究首先对病毒的命名有重大意义。因为目前的病毒的命名,大部分是根据其形态,而不是遗传信息(Genetic materials)命名的。这一电镜照片,为该病毒定了准确的名称,就是一种新型的冠状病毒。冠状病毒实际上目前已经有很多种,传染性和破坏性并不强。但是,这次武汉2019年爆发的是一种新型的冠状病毒,新型是说其基因组序列,并不是形状。

(2)探针的公布,以及现在全基因组序列的完成(目前发现该病毒有30473个碱基)对于开发新的快速检测方法,设计靶向药物,开发疫苗都具有非常重大的意义。

来源:科技日报

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