近日，华中农业大学动物科学技术学院曹罡课题组与信息学院李国亮课题组改造4C染色质构象捕获技术，捕获了α—疱疹病毒和宿主的“跨界”染色质互作，为病毒和宿主基因组之间的染色质相互作用及病毒基因转录调控提供了新见解。相关研究成果发表于《科学进展》。
团队使用伪狂犬病病毒（PRV）作为模型病毒，进行了染色体构象捕获分析，证明病毒与宿主之间特异性跨物种全基因组染色质相互作用。结果显示，PRV基因组由宿主DNA结合蛋白RUNX1介导、与宿主染色质开放区和转录活跃区有交互。这有助于病毒劫持宿主II型RNA聚合酶，进行病毒基因的有效转录。这样的病毒基因转录会被RUNX1抑制剂或通过RNA干扰显著抑制。
研究团队在PRV感染的PK15细胞中进行了多重环状染色体构象捕获分析。利用设计的新方法，将来自PRV和宿主细胞基因组的遗传信息耦合成DNA嵌合片段，用于解析PRV基因组和宿主细胞之间的染色质相互作用。
研究提出了一种模型，PRV利用宿主DNA结合蛋白RUNX1将其基因组介导到开放染色质和活性转录区，促进病毒劫持宿主转录机制，最终及时有效地转录病毒基因。研究发现，RUNX1抑制剂Ro 5-3335抑制了宿主细胞中PRV的增殖，这可能是伪狂犬病毒和其他疱疹病毒诱导疾病的潜在候选药物。
这一发现为病毒和宿主基因组之间的互作提供了新见解，并阐明了病毒基因优先转录的分子机制，有利于进一步解析宿主细胞中寄生病毒详细的生命周期。
相关论文信息：https://doi.org/10.1126/sciadv.abf8962
来源：中国科学报
原文链接：http://news.sciencenet.cn//sbhtmlnews/2021/7/363686.shtm
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