来源:中国化学会
图2. 不同C碱基衍生物的电荷密度及其DNA酶活性测量
接着,作者利用密度泛函理论(DFT)研究不同C碱基衍生物与H2O2之间的相互作用。结合实验结果,作者发现G4末端C碱基上N3的电荷密度越高,则C碱基与H2O2的结合力越强,所形成的DNA酶活性也会越高(图3)。作者还发现修饰之后的C碱基并不一定只和H2O2形成1:1的氢键网络,有可能会形成多个结合面,溶剂体系中的水分子也会与DNA酶体系发生作用而影响DNA酶活性。
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