植物DNA条形码2.0与系统发育基因组学”研讨培训班第二轮通知

来源：云南省植物学会

基于DNA序列的物种鉴定和系统发育研究具有基础性、可预测和易传承等特点，为当下生物多样性研究、保护与合理利用提供了重要科学支撑。使用DNA序列数据开展物种鉴定和系统发育关系重建也是当今生命科学和生物技术领域的一个前沿和热点方向。随着DNA测序技术的飞速发展，该领域的工作已从个别片段或少数基因进入到基因组水平，植物DNA条形码的研究和应用已逐渐进入2.0时代，分子系统发育相关研究也步入系统发育基因组学时代。 

随着2003年DNA条形码的提出和随后国际相关研究计划的实施，中国科学院于2009年和2017年先后启动了依托中国西南野生生物种质资源库的“植物DNA条形码研究”和“植物DNA条形码2.0与系统发育基因组学研究”开放研究项目。通过开放研究项目和科技部、国家自然科学基金委员会相关项目的实施，聚集了中国科学院和相关优势单位一批植物学研究人员在相关领域开展了广泛而深入的研究，推动了ITS/ITS2作为植物核心条形码和质体基因组作为超级条形码的发展，深度解析了植物几大类群和一些关键科属的系统发育关系，多学科、多手段的综合应用解决了一些困难类群和药用植物物种鉴定问题。同时，相关实验、数据分析组装及注释技术，数据库的建立和不断完善，标准数据库建设均取得明显进展，极大促进了传统植物学向基于大数据的系统研究和面向产业应用的发展，夯实了我国在植物DNA条形码研究领域业已形成的引领地位。 

经研究，定于2020年12月7日-11日在昆明举办“植物DNA条形码2.0与系统发育基因组学”研讨培训班。本次研讨培训班拟组织中国科学院植物学两所三园和相关大学的专家和青年研究人员，就我国植物DNA条形码2.0和系统发育基因组学研究领域的现状、发展趋势、面临的问题、发展瓶颈和应用前景等进行研讨和交流，以期提出新见解、新观点和新思路，并对从事该领域的青年研究人员进行实战培训，提升DNA条形码和系统发育基因组学的研究能力和技术水平，促进生物多样性科学和相关技术的发展。

一、组织机构

主  办：中国科学院昆明植物研究所

承  办：中国西南野生生物种质资源库

             国家重要野生植物种质资源库

             吴征镒科学基金会

             云南省植物学会

             全国科学院联盟生物多样性分会 

二、会议时间和地点

时    间：   2020年12月7日-11日

报到地点：昆明惠玥温德姆酒店大堂

报到时间：12月6日8:00-21:00（外地代表）

                  12月7日（本地代表）

三、会议内容

11月7日  研讨报告            昆明惠玥温德姆酒店

11月8日  应用+培训报告   昆明惠玥温德姆酒店

11月9日  数据分析培训     昆明惠玥温德姆酒店

11月10日 二代测序文库构建实践培训  中国西南野生生物种质资源库

11月11日  野外实践           昆明近郊

注：详见会议日程

四、会议注册

1. 参会代表唯一注册网址：

http://GBOWS2020.scimeeting.cn

2. 会议微官网

3. 注册时间：2020年11月9日 - 12月1日

4. 会议注册费：

注：开据增值税普通电子发票，注册交费时请完整填写单位名称和纳税人识别号。

5. 缴费方式

（1）线上缴费：通过会议网站或微官网注册报名，使用支付宝或微信扫描二维码进行缴费，支付前请先确定本单位可报销方式。

（2）汇款缴费：通过会议网站或微官网注册报名后，汇款到以下账户，并将汇款凭证上传至会议网站即可完成缴费。

开户名：云南省植物学会

开户行：交通银行云南省分行营业部

账  号：5310 0010 0010 330000133

汇款请备注：培训会+姓名。如多人同时缴费，需列上全部姓名。

6. 会议用餐统一安排，交通和住宿费用自理。

7. 注册费一经缴纳，不再退款，可转给同单位的参会代表。

五、住宿推荐

昆明惠玥温德姆酒店

标准间￥380元/天（会议协议价）

地点：昆明市盘龙区龙溪路99号

六、会议交通

1. 机场到酒店

空港快线：到达层乘坐空港快线1号线到火车北站（昆明雄业大酒店）站，乘坐23路公交车（北部公交枢纽站方向）至北部公交枢纽站，步行1.1公里（约15分钟）到达，全程约2小时5分钟。

地铁：地下层搭乘地铁6号线（塘子巷方向）到达塘子巷站（7站），站内换乘2号线，搭乘2号线（北部汽车站方向）到达司家营站（B口，10站），在司家营（北京路）站搭乘Z65路到新云路口（龙溪路 27分钟）站，全程1小时41分。

出租车：约150元，行驶里程数45公里，全程约40分钟。

2. 昆明南站（高铁站）到酒店

地铁：昆明南火车站搭乘1号线至饵季路（B1口，九站），转乘C101路（6站）到北部公交枢纽站，步行1.1公里（约15分钟）到达，全程1小时58分钟。

出租车：约150元，行驶里程数44公里，全程约1小时1分钟。

3. 昆明火车站到酒店

地铁：昆明火车站搭乘地铁1号线（14站）到北部汽车站（A口），步行1.6公里（约22分钟）到达，全程约58分钟。

出租车：约52元，行驶里程数20公里，全程约40分钟。

七、会务人员

会务咨询：

曾春霞 15911570235 zengcx@mail.kib.ac.cn

贺  伟 13808709991 hewei@mail.kib.ac.cn

林  晨 18669030511 linchen@mail.kib.ac.cn

李  培 18587190989 lipei@mail.kib.ac.cn

注册缴费：

康 珠 13669746006 kangzhu@mail.kib.ac.cn

杨云珊 13888179794 ysyang@mail.kib.ac.cn

附件：会议日程

                               中国科学院昆明植物研究所

                                       云南省植物学会

                                     2020年11月20日

数据分析培训

时间：2020年12月9日

地点：昆明惠玥温德姆酒店

一、培训目的

针对生物信息学背景较弱的研究生和科研人员，通过培训能快速并准确地掌握细胞器基因组de novo组装和注释，提高数据处理和分析能力。

二、培训目标

本次培训讲座和演练相结合，课程将会从软件包安装开始，逐步深入进行数据组装、处理和相关的多样性、物种鉴定和系统发育分析等。

三、培训内容安排

1. DNA 测序技术和质体基因组介绍

2. 细胞器基因组装软件GetOrganelle工作流程介绍

3. 叶绿体基因组结构变异和常见问题

4. 细胞器基因组注释方法

5. DNA序列比对方法和常用方法

四、培训团队

郁文彬，中国科学院西双版纳热带植物园，副研究员

金建军，美国哥伦比亚大学，博士后

张志荣，中国科学院昆明植物研究所，工程师

李  鑫，中国科学院西双版纳热带植物园，研究实习员

五、注意事项

1. 参加人员需自带笔记本电脑，了解Linux 或 macOS常用操作命令；

2. 从事过DNA序列处理、比对和分析；

3. 了解高通量测序数据和de novo组装。

二代测序文库构建实践安排

（需要遴选，限定40人）

时间：2020年12月10日

地点：中国科学院昆明植物研究所/中国西南野生生物种质资源库301实验室

一、实践目的

通过实验操作，掌握二代测序文库制备、质控的基本方法及操作技巧。

二、工作目标

每组完成2-4个标准DNA样品的二代测序文库制备、质控。

三、分组安排

组织协调：杨 静， 13759425348

A组领队：林春艳，15887820171

B组领队：张金萍，13888085363

C组领队：杨志云，15287117706

D组领队：杨丽萍，18387108564

四、注意事项

1. 参加人员严格遵守实验室的规章制度，不私自动用仪器及实验用品；

2. 实验操作时穿着实验服，佩戴实验手套；

3. 培训过程中，如遇身体不适请及时告知会务人员。

野外实践安排

（需要遴选，限定40人）

时间：2020年12月10日

9:00-9:30 DNA材料采集技术规范

9:30-17:00 野外采集分组实践

地点：昆明近郊

一、实践目的

通过野外实操，掌握野外采集DNA材料、标本压制、图像拍摄、数据填写等技术和规范的要点。

二、工作目标

完成10号（每人单独完成1-2号）DNA单元的采集。

人员安排：

注：

1. 参加人员须带相机、GPS；

2. 自备适合野外工作的衣物、鞋袜和防雨防晒用具等；

      3. 培训过程中，身体若有不适反应的请及时告知会务人员。