番茄病毒病其病毒病原有20多种，主要有黄瓜花叶病毒、烟草花叶病毒、烟草卷叶病毒和苜蓿花叶病毒、番茄斑萎病毒等。病毒主要通过汁液接触传染，只要寄主有伤口，即可侵入，土壤中的病残体、越冬寄主残体、烟叶烟丝均可成为初侵染源。蚜虫为害、农事活动都可传毒。番茄病毒病的发生和环境条件、植株生长势强弱关系密切，植株生长势衰弱，高温、干旱利于发病，氮肥使用偏多或土壤瘠薄、板结，或粘重、排水不良发病重。
防治方法：
必须认真执行“预防为主、综合防治”的植保方针，全面搞好农业、化学、生物等综合防治措施。
1、实行轮作、深翻改土，结合深翻，土壤喷施“免深耕”调理剂，增施有机肥料、磷钾肥、微肥和生物菌肥，适量施用氮肥，改善土壤结构，提高保肥保水性能，促进根系发达，植株健壮。
2、选用抗病品种，培育无菌壮苗，减少病害发生。种子用10％磷酸三钠或500倍高锰酸钾药液消毒；或用干热法对种子消毒（把种子充分晒干，使其含水量降至8%以下，后置于恒温箱内，在72℃条件下处理72小时），杀死种子所带病毒。
3、搞好肥水管理，调控好植株营养生长与生殖生长的关系，促进植株长势健壮，提高营养水平，增强抗病能力。
4、注意观察，发现少量病株立即拔除，铲除病原。
5、化学药剂防治：注意及时消灭蚜虫的同时，可用1500倍“天达裕丰”+600倍“天达瓜果宝”（瓜茄果型“天达-2116”）药液，或1000倍50%消菌灵药液+600倍“天达瓜果宝”药液，每10-15天一次，连喷3～5次；或用83增抗剂100倍液在定植前后各喷一次，后继续喷洒“天达裕丰”+“天达瓜果宝”药液，每10～15天一次，连喷3～4次，既可有效地控制辣（甜）椒病毒病的发生与蔓延，又能促进植株健壮，改善品质，增产20%～30%。