Nature：大规模！1124种植物转录组测序，解密绿色植物的进化

来源：BioArt植物

一个由近200名植物科学家组成的国际联盟公布了1100多种植物的转录组测序，这是一个为期9年的研究项目—— One Thousand Plant Transcriptomes Initiative（1KP）。1KP是一个全球性的合作项目，旨在研究植物物种、基因和基因组的多样性，这些多样性跨越了从开花植物和绿藻的祖先开始的超过10亿年的绿色植物历史。该项目由加拿大阿尔伯塔大学教授 Gane Ka-Shu Wong于2018年11月发起。

植物多样性（Nature, 2019）

作为1KP项目的一部分，现已完成了1124种植物的转录组测序及分析工作，研究结果为10亿年的绿色植物进化提供了框架。2019年10月24日，相关内容以One thousand plant transcriptomes and the phylogenomics of green plants为题发表在Nature上。

地球上绿色植物（viridiplanate）约有45~50万种，这些植物具有丰富的多样性和高度的进化时间尺度，并在陆地和水生生态系统中具有重要作用。该研究对1124种广义上的植物进行了转录组测序。这些植物在选择上具有代表性，包括绿色植物、共生藻和红藻。研究结果为绿色植物的进化提供了一个强有力的系统基因组框架。 

该研究揭示了全基因组复制的时间，以及基因家族的起源、扩张和收缩，有助于推动绿藻、苔藓、蕨类植物、针叶树、开花植物和其它绿色植物谱系的进化。植物如何以及在何时开始长高、结出种子、花朵和果实的历史，为理解地球上植物多样性提供了一个框架。值得注意的是，该研究发现，在绿色植物、陆地植物和维管植物起源之前，基因家族就有了大范围扩展，而全基因组复制则是在开花植物和蕨类植物的进化过程中反复发生。 

The distribution of inferred ancient WGDs across lineages of green plants.

有来自130多个国内外单位，近200名科学家参与了这项工作。国内有中国海洋大学、深圳市中国科学院仙湖植物园、中科院北京基因组所、东北农业大学、青岛农业大学、华大基因、中国农科院深圳基因组所、中科院华南植物园以及云南农科院花卉研究所等单位参与了该工作。

论文链接:

https://www.nature.com/articles/s41586-019-1693-2