GUT：北京协和医院发表胰腺神经内分泌肿瘤分子分型模型

来源：BioArt

胰腺神经内分泌肿瘤（pancreatic neuroendocrine tumour, PanNET）是来源于胰腺神经内分泌细胞的一类肿瘤，患病率逐年上升【1,2】；临床上可分为功能性胰腺神经内分泌肿瘤（最常见的是胰岛素瘤（Insulinoma））和无功能性胰腺神经内分泌肿瘤（non-functional pancreaticneuroendocrine tumours, NF-PanNET）【3】。近年来国内外测序研究已发现胰腺神经内分泌肿瘤的常见突变【4-8】，但功能性肿瘤、特别是胰岛素瘤和NF-PanNET之间系统的基因组水平差异仍有待探索。

近日，由北京协和医院赵玉沛院士领衔，北京协和医院吴文铭团队与深圳华大生命科学研究院吴逵团队合作在Gut杂志上发表了题为Whole-genome sequencing reveals distinct genetic bases for insulinomasand non-functional pancreatic neuroendocrine tumours: leading to a newclassification system的研究论文，探究PanNET主要临床分型的基因组水平差异。通过合作研究，利用多组学测序测序技术，系统比较了胰岛素瘤和NF-PanNET基因组水平差异，基于基因组拷贝数变异（Copy Number Variation, CNV）及单碱基突变，提出了分子分型模型，并揭示CNV对NF-PanNETs预后的预测价值【9】。

研究团队对比胰岛素瘤及NF-PanNET基因组数据，发现胰岛素瘤和NF-PanNET呈现出不同的突变特征。且在CNV层面上，胰岛素瘤主要以拷贝数中性和拷贝数扩增为主；NF-PanNET主要以拷贝数中性、拷贝数扩增和拷贝数缺失为主；并以此提出5种亚型的分子分型。

通过比较分子分型模型中不同亚型预后，提示拷贝数扩增、拷贝数缺失的NF-PanNET复发风险较高；同时，拷贝数扩增、拷贝数缺失的NF-PanNET中DAXX/ATRX基因突变比例较高，联合拷贝数变化及DAXX/ATRX基因突变有助于更精准的预测NF-PanNET的复发风险和时机。

综上，该研究对胰腺神经内分泌肿瘤不同临床亚型的基因组变化进行了更深入研究，解释了临床分型与分子分型之间的关联，提出了新的预后判断指标，为该疾病机制的研究、临床的精准治疗提供了研究基础。

 原文链接：

https://doi.org/10.1136/gutjnl-2018-317233

参考文献

1. Yao JC ,Hassan M , Phan A , et al . One Hundred Years After “Carcinoid”: Epidemiologyof and Prognostic Factors for Neuroendocrine Tumors in 35,825 Cases in theUnited States. JCO;26:3063–72 (2008).

2. Dasari A ,Shen C , Halperin D , et al . Trends in the incidence, prevalence, and survivaloutcomes in patients with neuroendocrine tumors in the United States. JAMAOncol;3:1335–42 (2017).

3. Wu WM , Jin G, Li HM , et al . The current surgical treatment of pancreatic neuroendocrineneoplasms in China: a national wide cross-pal study. JPancreatology;2:35–42 (2019).

4. CaoY , Gao Z , Li L , et al . Whole exome sequencing of insulinoma revealsrecurrent T372R mutations in YY1. Nat Commun (2013).

5. JiaoY , Shi C , Edil BH , et al . DAXX/ATRX, MEN1, and mTOR pathway genes arefrequently altered in pancreatic neuroendocrine tumors. Science;331:1199–203(2011).

6. ScarpaA , Chang DK , Nones K , et al . Whole-genome landscape of pancreaticneuroendocrine tumours. Nature;543:65–71(2017).

7. CromerMK , Choi M , Nelson-Williams C , et al . Neomorphic effects of recurrentsomatic mutations in Yin Yang 1 in insulin-producing adenomas. Proc Natl AcadSci U S A;112:4062–7(2015).

8. Wang H ,Bender A , Wang P , et al . Insights into beta cell regeneration for diabetesvia integration of molecular landscapes in human insulinomas. Nat Commun;8:767(2017).

9. Hong X, QiaoS, Li F, et al Whole-genome sequencing reveals distinct genetic bases forinsulinomas and non-functional pancreatic neuroendocrine tumours: leading to anew classification system Gut Published Online First: 28 August 2019. doi:10.1136/gutjnl-2018-317233