▲像素化的空间基因表达芯片，可以在两小时内完成对整个组织样本的分析。引用：伊利诺伊大学
近日，《自然·通讯》发表了美国伊利诺伊大学和梅奥合作研发的新型基因表达分析技术，该方法可以从肿瘤组织样本中快速、直接地检测RNA水平，同时保留整个组织的空间结构。
现有的基因表达检测方法存在很大的局限性，操作繁琐且耗时较长。基因表达的终产物——蛋白质的检测也操作复杂、需要制备抗体，而且在分析动物模型和异种移植时，目标抗体与宿主抗原可能会出现交叉反应，造成假阳性。
而最新研发的像素化的空间基因表达芯片，可以在两小时内完成对整个组织样本的分析，检测信使RNA的表达，得到相比蛋白质检测更多、更准确的遗传信息。研究小组领导者之一Farhad Kosari说：“我们的技术会对整个组织样本进行像素化，并识别出那些可能癌变的细胞。目前，还没有任何技术可以将原始组织样本转化为核酸扩增，同时保留空间结构。”
新型的基因表达芯片有指甲大小，其中包含5000多个具有锋利边缘的金字塔形的小孔。当把1厘米大小的肿瘤组织样本放置在芯片上时，芯片会将它切割成几千个微小的碎片，然后用环介导等温扩增（LAMP）技术进行分析。
Kosari说:“过去我们用激光捕获显微切割（LCM）后纯化扩增的方法观察染色组织样本的特定区域，并分析其异质性，而我们现在的技术，相当于在芯片上直接进行5000多个LCM反应并进行下游扩增。”
这项新技术可能会帮助医生和病理学家确定肿瘤的界限，提高肿瘤切除手术的效果。
该小组将继续研究基因表达技术，并利用它来确定肺癌、乳腺癌和前列腺癌的基因突变表达谱，他们还在努力减少芯片上小孔的大小，从而在更高的分辨率下检测单个细胞。
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编译：花花 审稿：alone 编辑：张梦
来源：https://phys.org/news/2018-01-chip-based-gene-tool-rna-quickly.html
