中国农科院基因组所开发高效率、低成本重测序文库制备新方法

来源：中国农科院基因组所

近日，Plant Methods在线发表基因组所常玉晓课题组题为“All-in-one sequencing: an improved library preparation method for cost-effective and high-throughput next-generation sequencing”的研究论文，报道了新的重测序文库制备方法。这种名为“AIO-seq”的新方法简化了文库制备的流程，极大地降低了文库制备的成本，为NGS在育种中应用扫除了高成本障碍。

全基因组基因型鉴定在育种中具有重要的作用。虽然目前基于二代测序的全基因组基因型鉴定在技术层面已经非常成熟，但是其高昂的价格限制了在育种中的广泛应用。育种家普遍期望单个样本的全基因组基因型鉴定的价格能够降低至10美元左右。 围绕这一技术难题，常玉晓课题组优化了常规的重测序文库制备方法，将传统方法文库扩增后的文库分选和定量这两个步骤，从“每个样品单独操作”的繁琐流程，优化为“多个样品混合操作”的简化流程。通过简化，可以实现一百多份样品混在一起只进行一次文库的分选和定量，大大降低了重测序文库的建库时间成本和试剂成本。此外，该方法还结合质量越来越好的国产建库试剂，进一步降低了试剂成本。最终应用新方法AIO-seq，可以将全基因组基因型鉴定的成本降低到育种家期望的10美元，为NGS在育种中的广泛应用扫除了障碍。

All-in-One sequencing (AIO-seq) 方法的基本流程 中国农业科学院农业基因组所博士生赵胜和广西大学张翠翠副教授为并列第一作者，基因组所常玉晓研究员和河南农业大学丁俊强副教授为共同通讯作者。