来源:Nature自然科研
5月4日《自然》发表的一篇论文Rapid reconstruction of SARS-CoV-2 using a synthetic genomics platform描述了一种可以快速制造合成版新冠病毒SARS-CoV-2的方法。重建新发病毒有助于研究人员开发诊疗方法和疫苗。
在实验室重建病毒是一种有用的研究疾病暴发所涉病原体的方法。发生疫情时,将病毒样本送至研究机构可能需要很长时间,或者转运这些病原体被认为过于危险。许多病毒是利用大肠杆菌进行复制的,但是冠状病毒过大,不易使用这些细菌克隆。酵母是可用于合成病毒基因组的另类方法,瑞士伯尔尼大学的 Volker Thiel、Joerg Jores及同事便是利用酵母制造出了合成版SARS-CoV-2。
作者使用2020年1月初公布的SARS-CoV-2基因组序列作为模板,将其分成12个重叠的片段,并从一家生物技术公司订购了14个合成冠状病毒DNA的短序列;目的是重组这些片段,重建出SARS-CoV-2基因组序列——但是缺少两个片段。不过,研究人员从本地一名感染SARS-CoV-2的患者身上获得了样本,得以制造出缺失的片段。经过多次克隆和调整,最终生成了与患者样本非常类似的SARS-CoV-2合成基因组,不过还是观察到了一些复制差异。
作者总结表示,收到DNA片段一周后便生成了合成病毒,这样的速度使得这种方法颇具吸引力:无需获取临床样本,便能向卫生机构和诊断实验室提供感染性病毒。
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Nature| DOI: 10.1038/s41586-020-2294-9
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Rapid reconstruction of SARS-CoV-2 using a synthetic genomics platform
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