7500多个病毒基因组分析，揭示 SARS-CoV-2病毒进化起源

来源：生物通

伦敦大学学院遗传学研究所领导的研究小组分析了7500多COVID-19患者携带的病毒基因组，并开发了一个交互式的、开源的在线应用程序，方便全球研究人员审查这些病毒基因组，并应用类似的方法更好地了解其进化轨迹。

伦敦大学学院遗传学研究所领导的研究小组分析了7500多COVID-19患者携带的病毒基因组，并开发了一个交互式的、开源的在线应用程序，方便全球研究人员审查这些病毒基因组，并应用类似的方法更好地了解其进化轨迹。

他们在《Infection, Genetics and Evolution》发文，描述了SARS-CoV-2病毒基因组的多样性模式，为其进化和药物疫苗研发提供了靶向线索。

这项研究发现了病毒中近200个反复出现的基因突变，全球遗传多样性很大程度来自受影响最严重的的国家，表明这种流行病从早期就在全球范围内传播了，而且大多数国家不存在单一的“零号病人”基因。

该文进一步证实了该病毒在2019年10月6日至2019年12月11日才出现，随后迅速在全球蔓延开来。科学家通过来自全球7500多例患者携带的病毒基因组，发现了198个独立发生过不止一次的突变。

“所有病毒都会发生自然变异，突变本身并不是坏事，也没有任何迹象表明SARS-CoV-2突变的速度比预期的慢或快。到目前为止，我们不能得出SARS-CoV-2正变得越来越致命和具有传染性这样的结论，”联合作者Francois Balloux教授说。

这些微小的基因变化（突变）并不是均匀地分布在病毒基因组中的，病毒的某些部分几乎没有突变，这些不可变的部分很可能是药物和疫苗开发的好靶点。

“一种药物如果针对在病毒发生变异的部分，那么它就可能随时失效，”Balloux教授解释。“如果我们把精力集中在病毒不太可能变异的部分上，就有更好的机会成功开发出长效的药物。”

“我们发现一些差异彼此独立地多次出现，说明这些突变有更多的利用价值，可以开展进一步研究了解它们的作用，”文章主要作者Lucy van Dorp博士说。

这篇文章进一步证明了，自2019年底以来的SARS-CoV-2病毒有着共同的祖先，表明这次的病毒是从动物宿主身上跳到了人类的身上，之前很长一段时间都应该待在动物宿主身上。

包括英国在内的许多国家的病毒样本多样性几乎与全球病例一样多，意味着病毒曾经多次独立地进入英国，而不是通过任何一个指标个案。

我们一直都在对病毒基因组进行测序，并发布在网上，全球数百名研究人员在大流行开始几个月内分析了如此数量惊人的病毒基因组，这是过去十年内基因组学进展的集中展示，van Dorp博士总结。

参考文献

Emergence of genomic diversity and recurrent mutations in SARS-CoV-2