Cell ： 重大进展，陈玲玲团队发现不同物种加工及定位非编码RNA有差异

来源：iNature

lncRNA的亚细胞定位与其功能有关。顺式和反式因子均可影响亚细胞定位和加工，其可以导致具有不同亚细胞命运的不同RNA同工型。然而，到目前为止，仍未探索lncRNA加工是否保守以及加工如何促进其在不同物种中的区室化和功能。

2020年4月6日，中国科学院上海生化细胞所陈玲玲团队在Cell 在线发表题为“Distinct Processing of lncRNAs Contributes to Non-conserved Functions in Stem Cells”的研究论文，该研究报告人类和小鼠胚胎干细胞（ESC）中lncRNAs的不同亚细胞定位。与mESCs相比，在hESCs的细胞质中定位的lncRNA的比例明显更高。事实证明，这对于hESC多能性很重要。 

FAST是位置保守的lncRNA，但在其加工和定位中不保守。在hESC中，定位于细胞质的hFAST与E3泛素连接酶β-TrCP的WD40结构域结合，并阻断其与磷酸化β-catenin的相互作用，以防止降解，从而导致多能性所需的活化的WNT信号传导。相比之下，mFast是保留在mESC中的核，并且其加工受到剪接因子PPIE的抑制，剪接因子PPIE在mESC中高度表达，而在hESC中却没有。这些发现表明，lncRNA加工和定位是功能快速发展的先前未被充分认识的因素。

在进化过程中，物种之间的mRNA序列和翻译的蛋白质序列的保守性很高，并且在功能上具有重要意义。相反，长的非编码RNA（lncRNA）通常缺乏二级结构保守性。lncRNA保守也可能发生在位置和作用机制水平上。在不同物种之间具有附近保守编码基因的位置保守lncRNAs的转录，已被认为是潜在功能意义的指标。尽管人们认为作用机制与细胞中特定的RNA构象有关，但由于缺乏基本结构模块的实验数据，RNA结构分析仍然是一个挑战。人们已经认识到越来越多的lncRNA在各种细胞过程中起着重要的作用，但仍然需要关注其功能在何种程度上被保守。

lncRNA的亚细胞定位与其功能有关。顺式和反式因子均可影响亚细胞定位和加工，其可以导致具有不同亚细胞命运的不同RNA同工型。然而，到目前为止，仍未探索lncRNA加工是否保守以及加工如何促进其在不同物种中的区室化和功能。

胚胎干细胞（ESC）来源于哺乳动物胚泡胚胎的内部细胞团，并具有自我更新和分化为特定细胞类型的能力。尽管人类胚胎干细胞（hESC）和小鼠胚胎干细胞（mESC）在多能性方面具有一些共同的特性，包括高碱性磷酸酶和端粒酶活性，但它们具有独特的形态，干性标记，生长条件和外在信号。lncRNA是否有助于hESC和mESC之间的这些差异尚不清楚。

在这里，研究人员从hESCs和mESCs分析了保守的lncRNA，以检查它们的加工和亚细胞定位是否保守。令人惊讶地，研究人员发现hESC与mESC之间lncRNA的定位模式是不同的。hESC中保守的lncRNAs常常与增加的细胞质定位结合在一起，这是多能性调节和反式因子差异表达所必需的。这种独特的RNA加工，定位和随后的功能以前没有得到足够的重视。

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