研究进展：肠道中的共生微生物和致病细菌的成像

作为一个新发现的器官，在过去的二十年中，肠道菌群得到了广泛的研究，它们在宿主众多器官和系统的生理病理过程中的高度多样化和基础性的作用逐渐被揭示。但是，当前大多数研究严重依赖于DNA测序的方法。为了真正了解共生和致病性肠道细菌表现出的复杂功能，我们需要更强大的方法和工具，其中最适合的成像策略是能够在不同环境中接近该生态系统原位状态的策略。

在此综述中，上海交通大学医学院杨朝勇&王炜重点介绍了其团队和其他实验室在开发肠道中共生微生物和致病菌可视化策略方面的最新进展。首先，作者总结了在开发抗生素衍生的荧光探针方面所做的努力，该探针直接结合特定的细菌表面结构，以实现选择性标记不同种类的肠道细菌。接下来，详细讨论了，基于代谢标记的非天然糖和稳定同位素的成像策略，在不同情景中和多种尺度上对肠道细菌进行成像。然后，文章介绍了基于核酸染色的细菌成像，使用一般的核酸结合试剂或选择性标记技术（例如荧光原位杂交（FISH））来满足各种应用场景中肠道菌群研究的需求。近年来，由于一系列新技术的进步，核酸染色这种经典的成像策略也迎来了复兴。此外，尽管在许多的肠道共生细菌中进行基因操作存在极大的困难，但科学界最近在利用荧光蛋白和声响应蛋白等报告基因来改造肠道细菌方面也做出了巨大的努力。最后，文章还介绍了对这一新兴领域当前的局限性以及发展趋势的看法。

文献链接：
Imaging Commensal Microbiota and Pathogenic Bacteria in the Gut，Acc. Chem. Res.，2021

原文链接：
http://www.cailiaoniu.com/221499.html